סוג האירוע

בחר הכל

הרצאות פומביות

מבחן/תחרות

סמינרים

קולוקוויום

כנסים וימי עיון

צהרי יום א'

ימים פתוחים וייעוץ

טקסים ואירועים מיוחדים

הרצאות לקהל הרחב

מועדון קשרי אקדמיה-תעשייה

תחום האירוע

בחר הכל

הפקולטה למדעים מדויקים

ביה"ס למדעי המתמטיקה

ביה"ס לפיזיקה ולאסטרונומיה

המועדון האסטרונומי

ביה"ס לכימיה

מרכז לחקר אינטראקציות אור חומר

פרס סאקלר במדעים הפיזיקליים - כימיה

סימפוזיונים והרצאות מיוחדות

החוג למדעי כדור הארץ

ביה"ס למדעי המחשב

ביה"ס למדעי כדור הארץ

החוג ללימודי הסביבה

סמינר לפיזיקה של מערכות ביולוגיות וחומרים רכים: Protein-DNA binding in the absence of specific base-pair recognition

David Lukatsky, BGU

12 בנובמבר 2014, 11:10 
בניין שנקר פיזיקה, חדר 105 
סמינר לפיזיקה של מערכות ביולוגיות וחומרים רכים

abstract:

Until now, it has been reasonably assumed that specific base-pair recognition is the only mechanism controlling the specificity of transcription factor (TF)-DNA binding. Contrary to this assumption, we have shown that nonspecific DNA sequences possessing certain repeat symmetries, when present outside of specific TF binding sites (TFBSs), statistically control TF-DNA binding preferences. We used high-throughput protein-DNA binding assays to measure the binding levels and free energies of binding for several human TFs to tens of thousands of short DNA sequences with varying repeat symmetries. Based on statistical mechanics modeling, we identify a new protein-DNA binding mechanism induced by DNA sequence symmetry in the absence of specific base-pair recognition, and experimentally demonstrate that this mechanism indeed governs protein-DNA binding preferences.

References: Ariel Afek, Joshua L. Schipper, John Horton, Raluca Gordân, and David B. Lukatsky, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, doi: 10.1073/pnas.1410569111, (Early Edition, Oct 13) (2014) http://www.pnas.org/content/early/2014/10/08/1410569111.

 

מארגן הסמינר: גיא יעקובי

אוניברסיטת תל-אביב, ת.ד. 39040, תל-אביב 6997801
UI/UX Basch_Interactive